A estrutura organizacional do INEX é constituída por diferentes planos de responsabilidade. Para além dos investigadores principais, José Maia e Ricardo Fernandes, o “core” investigativo assenta em quatro domínios - biológico (responsáveis: Filipa Sousa/José Maia), habilidades específicas/proficiência no jogo (responsável: Fernando Tavares), psicológico (responsável: Cláudia Dias) e contextual (responsável: José António) que dirigem o seu “olhar” para a complexidade de cada uma das cinco modalidades – andebol, basquetebol, futebol, polo aquático e voleibol. O projeto tem uma comissão de acompanhamento externo de que fazem parte investigadores internacionalmente reconhecidos: Adam Baxter-Jones (Canadá) e Mark Williams (USA).
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